Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBF4Q9BQW3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms