Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHCQ99643 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms