Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMG1Q96Q15 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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