Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms