Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI9

CXorf58, Putative uncharacterized protein CXorf58, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf58Q96LI9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXorf58Q96LI9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms