Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms