Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms