Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms