Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms