Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E3Q969T4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms