Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX21Q969T3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms