Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRF1Q92994 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRF1Q92994 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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