Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms