Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN4Q92575 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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