Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATAD2BQ8WXI9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms