Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRSK1Q8TDC3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms