Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HJURPQ8NCD3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HJURPQ8NCD3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms