Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H1FOOQ8IZA3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms