Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNTD2Q8IXW0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNTD2Q8IXW0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms