Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF2Q8IX21 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF2Q8IX21 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms