Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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