Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms