Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9AQ7Z3C6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms