Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms