Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFCAB12Q6NXP0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms