Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms