Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD7BQ6GQQ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms