Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms