Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM208BQ5VWN6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms