Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms