Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC158Q5M9N0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms