Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COLEC12Q5KU26 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms