Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC4Q5J8M3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms