Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC178Q5BJE1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms