Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBL2Q562R1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms