Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms