Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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KRTAP21-1Q3LI58 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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