Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL38Q2WGJ6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms