Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms