Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC96Q2M329 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms