Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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