Protein–RNA interactions for Protein: Q16625

OCLN, Occludin, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCLNQ16625 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OCLNQ16625 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms