Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFDHQ16134 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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