Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL1Q16048 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms