Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZFHX3Q15911 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ZFHX3Q15911 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ZFHX3Q15911 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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