Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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