Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF13Q15543 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms