Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SIX1Q15475 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SIX1Q15475 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SIX1Q15475 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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