Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYTH1Q15438 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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