Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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